上世纪80年代中后期，随着民进党成立、蒋经国去世、李登辉上台主政，台湾内部各种各样的“台独”团体组织蠢蠢欲动。海外“台独”与台湾内部“台独”组织更是分进合流，彼此“混为一家”。1970年1月初，鼓吹“台独”的彭明敏逃出台湾，经瑞典转往美国，分散在日本、西欧、美国等各地的“台独”势力首次集会于美国，宣布组成统一指挥、协调“台独”活动的“世界台湾人争取独立联盟”。1987年随着台湾当局宣布解除戒严，海外“台独联盟”改名为“台独建国联盟”，并于1988年设立负责在台湾内部发展“台独”势力的“发展建国委员会”，由前联盟主席张灿鍙任委员长。1994年，该组织最先打出“台独建国”旗号。1988年8月，由蔡有全等成立“台湾政治受难者联谊总会”，名义上是“政治受难者”的一个团体，实际上鼓吹“台湾人有主张台湾独立的自由”，目前许多民进党的高层都是出自这个组织。
“发源于美日，祸害于岛内”
谈到“台独”的早期背景，台湾资深媒体人孙明礼告诉《环球时报》记者，日本战败后不甘心“归还台湾”，在台湾鼓动一些“皇民化”的台湾本省人士，推动“日系台独组织”，同时战后美军为了“不要让中国强大”，也鼓动“美系台独组织”。这两类组织是台湾最先出现的一批“台独”组织，其中知名的前海基会董事长辜振甫的同父异母弟弟辜宽敏(母亲是日本人)就是最初的日系“台独”组织大佬之一，1947年他在日本组建“台独联盟”被国民党通缉，直到 1972年返台。2008年5月，辜宽敏曾参加民进党党主席选举，败于蔡英文。
撰写所谓“台湾人四百年史”的史明，则是日系美系“台独”分子中为“台独”打下理论基础的主要人物。孙明礼说，史明本名施朝晖，1937年赴日留学，在早稻田大学念政治经济学，参与过台湾文化协会的活动。1947年，他在大陆参与抗日活动，组成三百人左右的“台湾队”，在这段时间他第一次有了“台独”的想法。1952年，他在台北郊外山上组织“台湾独立革命武装队”，准备刺杀蒋介石，未料事件泄露，于同年偷渡到日本，而后就潜心于“台独理论的创造”及“台独史观的撰写”，为而后60年的“台独”组织提供“台独理论及历史基础”。虽然史明不是“台独”组织“明面上的大佬”，但“台独”内部把他看成是“台独导师”。李登辉、陈水扁时期“台湾优先”“同心圆历史观”等教育，使台湾岛内一些人“中国大一统”的观念逐渐泯然。
史明并不是第一个成立“台独”组织的人，“台独”的第一个正式组织要算是1945年日本天皇宣布投降后，其驻台湾总督安藤利吉策动部分军国主义分子和收买的岛内汉奸，在台湾建立密谋台湾“独立”的地下组织为开端，1951年廖文毅在东京正式成立所谓“台湾民主独立党”，这才算是“日系台独组织”的滥觞。
根据台湾中研院2012年“海外台独运动相关人物”书目介绍，美国是继日本之后推动“台独”的幕后黑手，上世纪五六十年代，美国炮制出所谓“台湾法律地位未定论”。这种“地位未定论”催生出一批“美系台独”，如旅美的台籍人士林劳勋等人1956年成立“台湾人的自由台湾”团体，1958年又正式成立以“台独”为目的的秘密组织。
在各类“台独”组织背后，离不开民进党的身影。“台独建国联盟”迁回台湾后，其成员集体加入民进党。1991年10月13日，民进党通过决议，在党纲中增加“建立主权独立自主的台湾共和国暨制定新宪法，应交由台湾全体住民以公民投票的方式选择决定”的内容，明目张胆地进行分裂中国的活动。
在一些学者和资深媒体人看来，台湾的“台独”团体是“发源于美日，祸害于岛内”。这些“台独”团体的经费有一大部分来自美日，加上绿营执政的县市越来越多，绿营政客以“补助民间团体”的名义，向它们提供“奶水”。目前，绿营在选战中占了上风，一些台湾企业、商人更是不再避讳提供“政治献金”给民进党或其他“台独”组织，这已引起维护两岸和平人士的警惕。
